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摘要： 复杂基因组的自动化无间隙组装迄今尚未实现。我们彻底改变了传统的基因组组装方法，设计出一种通用的基因组组装算法，它仅用易错数据就实现了复杂基因组的完美组装。在普通的计算服务器上，对16个样本的普通数据集做了测试，其中包括线虫、果蝇、拟南芥、水稻和瓢虫各三个和一个人类测序数据，它不仅全自动输出了所有16个样本的端到端无间隙的基因组，而且还准确预测出每个串联重复区域的边界坐标以及从中测序的所有读段。运行时间：三个线虫均用了约4 小时，三个果蝇均用了约4.5小时，三个拟南芥均用了约5.5小时，三个水稻均用了约6.5小时，三个瓢虫均用了约6小时，人类数据约1200小时。
个人简介：李国君，山东大学二级岗教授特聘教授。1996年获中科院数学与系统科学研究院博士学位。2004年受聘中科院软件所研究员，2006年受聘美国佐治亚大学研究教授。研究领域涉及图论、组合最优化和生物信息学。在图论领域的代表作品：证明了4个图论猜想，论文分别发表在JCTB和Combinatorica等。在组合最优化领域的代表作品：解决了两个有挑战性的算法理论问题，论文分别发表在SIAM J. Comput和ACM Trans. Algorithms等。在生物信息学领域：颠覆了组装基因组的传统方法，实现了包括人类基因组的全自动化端到端无缝隙的完美组装。
